6月14日Nature封面公布了人类微生物组计划的首批研究结果，这项重要的成果引人注目之处还在于其采用的新技术，在一篇Nature Methods题为“Metagenomic Microbial Community Profiling Using Unique Clade-Specific Marker Genes”的文章里，来自哈佛大学公共卫生系等处的研究人员就总结了一种新型分析方法，能有效的将人类微生物组的大量遗传信息进行分类筛选，分析这些微生物在机体中的功能，比如消化功能，或者减少炎症的功能。(实验室管理)
“正如人类基因组测序能帮助我们分析个体基因如何保护，或者干扰机体一样，这项研究也能用于解析人类健康的风险”。Huttenhower研究组不仅参与了这篇Nature Methods文章相关研究，而且也参与了完成了Nature，PLoS Computational Biology相关文章的研究。人体内有两个基因组，一个是从父母那里遗传来的人基因组，编码大约2.5万个基因；另一个则是出生以后才进入人体、特别是肠道内的多达1000多种的共生微生物，其遗传信息的总和叫“微生物组”，也可称为“元基因组”，它们所编码的基因有100万个以上。两个基因组相互协调、和谐一致，保证了人体的健康。因此，在研究基因与人体健康关系时，一定不能忽略共生微生物基因的研究。
最新这项公布的成果是人类微生物组计划的首批研究结果，从中“我们发现每个个体的微生物信号都是独一无二的”，Huttenhower说。(实验室管理)
Huttenhower研究组提出了一种新型的计算机方法，能用于筛选这些微生物群体，从中根据DNA测序得到的数据，找到了特殊的遗传标记。因此研究人员能快速分辨出这些细菌标记在健康志愿者体内哪儿，以及如何出现的。这种高灵敏度微生物检测技术，能用于多个方面，比如分析超过100个条件致病菌，了解这些细菌在侵入机体，引发疾病之前，位于机体的哪个位置。
在另外一篇PLoS Computational Biology 文章中，Huttenhower及其同事分析了这些微生物的功能，这需要在庞大的DNA序列数据中筛选，非某种特定微生物，而是某单个代谢过程的标记。(实验室管理)