Cell杂志5月最受关注十篇文章盘点
库巴扎新闻列表 | 2012-05-28

Cell创刊于1976年,以发表具有重要意义的原创性实验室管理科研报告为主,许多生命科学领域最重要的发现都实验室管理发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为:

1. Roles for MicroRNAs in Conferring Robustness to Biological Processes
Margaret S. Ebert, Phillip A. Sharp 

来自麻省理工,霍德华休斯医学院的实验室管理研究人员探讨了小分子RNA(miRNAs)如何应对复杂波动的外界环境,缓冲机体生物学网络功能。这篇宏观统筹文章公布在Cell杂志上,并作为前言特写文章推荐,目前文章免费阅读。对环境和遗传的波动变化,生物系统采用了各种不同的机制来维持其功能。目前有越来越的证据protocol表明,miRNAs作为一种基因表达转录后抑制因子,能通过加强转录过程,以及减少异常转录,从而帮助增强生物进程的强健性(Robustness)。并且这种分子也参与了一些网络作用,这有助于防止转录拷贝数量的随即波动。

2. Generation of Genetically Modified Mice by Oocyte Injection of Androgenetic Haploid Embryonic Stem Cells
Hui Yang, Linyu Shi, Bang-An Wang, Dan Liang, Cuiqing Zhong, Wei Liu, Yongzhan Nie, Jie Liu, Jing Zhao, Xiang Gao et al.

排在第一的这篇文章是由中科院上海生科院生化与细胞所完成的,这项研究获得了胚胎干细胞研究的最新成果:一种新型获得遗传修饰动物的改良方法,这一方法不同于传统方法,主要基于单倍体胚胎干细胞(haESCs)。这种新方法通过单倍体干细胞代替精子,首先需要将未成熟卵子(卵母细胞)中的细胞核移除,然后注入精子,这一过程将能产生haESCs(部分保留了来自父系的化学修饰特性),这将能代替精子。这样研究人员就能成功获得带有haESC遗传特性的活体小鼠,这些动物被称为“semicloned mice(半克隆小鼠)”,能成长为成体小鼠。

“通过易操控的基因操作,将遗传信息传递给后代,这些单倍体细胞为遗传修饰动物培育开辟了新途径”,研究人员如此写道,下一个挑战将是改进haESCs的精子样特性,这可以通过不影响细胞功能的优化方法。

3. Hallmarks of Cancer: The Next Generation
Douglas Hanahan, Robert A. Weinberg

这篇由癌症研究泰斗:Robert A.Weinberg完成的最新癌症综述是之前他的一篇文章“The Hallmarks of Cancer”的升级版——之前那篇文章介绍了肿瘤细胞的六大基本特征,被称为肿瘤学protocol研究的经典论文,到目前为止,这篇论文已经被引用了上万次。自给自足生长信号(Self-Sufficiency in Growth Signals);抗生长信号的不敏感(Insensitivity to Antigrowth Signals);抵抗细胞死亡(Resisting Cell Death);潜力无限的复制能力(Limitless Replicative Potential);持续的血管生成(Sustained Angiogenesis);组织浸润和转移(Tissue Invasion and Metastasis);避免免疫摧毁(Avoiding Immune Destruction);促进肿瘤的炎症(Tumor Promotion Inflammation); 细胞能量异常(Deregulating Cellular Energetics);基因组不稳定和突变(Genome Instability and Mutation)。

4. Cell-free Formation of RNA Granules: Low Complexity Sequence Domains Form Dynamic Fibers within Hydrogels
Masato Kato, Tina W. Han, Shanhai Xie, Kevin Shi, Xinlin Du, Leeju C. Wu, Hamid Mirzaei, Elizabeth J. Goldsmith, Jamie Longgood, Jimin Pei et al.

5. A Long ncRNA Links Copy Number Variation to a Polycomb/Trithorax Epigenetic Switch in FSHD Muscular Dystrophy
Daphne S. Cabianca, Valentina Casa, Beatrice Bodega, Alexandros Xynos, Enrico Ginelli, Yujiro Tanaka, Davide Gabellini

人类基因组中的重复序列占到一半以上。面肩肱肌营养不良症(FSHD)是一种常染色体显性疾病,它与定位在4q35上的D4Z4重复序列拷贝数量减少有关。D4Z4缺失可引发表观遗传学开关,从而抑制4q35基因。

6. Personal Omics Profiling Reveals Dynamic Molecular and Medical Phenotypes
Rui Chen, George I. Mias, Jennifer Li-Pook-Than, Lihua Jiang, Hugo Y.K. Lam, Rong Chen, Elana Miriami, Konrad J. Karczewski, Manoj Hariharan, Frederick E. Dewey et al.

来自斯坦福大学医学院的Michael Snyder领导完成了一项历时两年半的跟踪实验,他定期做抽血检查,跟踪监测细胞内的4万余种不同的分子的起伏变化情况:从激素到血糖,到免疫系统蛋白和突变的基因,无所不包。他也见证了遗传基因上易患糖尿病的自己,不久之后真的罹患此病。DNA检测表明,他罹患II型糖尿病的危险很高。虽然他的医生没有发现他正处于病情发展期的任何表征,他的自检还是查出了早期迹象。不久,他就患上了糖尿病。在确诊后,Snyder调节了饮食,加大了运动量进行减肥,控制住了病情。

7. A Role for Neuronal piRNAs in the Epigenetic Control of Memory-Related Synaptic Plasticity
Priyamvada Rajasethupathy, Igor Antonov, Robert Sheridan, Sebastian Frey, Chris Sander, Thomas Tuschl, Eric R. Kandel

来自美国哥伦比亚大学的研究人员发现piRNAs能通过调控CREB环路DNA甲基化,来编码神经细胞基因组中的记忆,这无疑对于记忆形成机理protocol研究具有重要意义。最新这篇文章指出了piRNAs在记忆相关突触可塑性的表观遗传调控方面的作用,他们首先从海兔(Aplysia)CNS中建立了小RNA文库,并从这些文库中,protocol发现了一个未预料到的piRNAs集,这些piRNAs长为28个核苷酸,在大脑中大量表达,这与之前认为piRNAs的生殖特异性相悖。这些piRNAs具有独一无二的合成模式,主要定位在细胞核中,而且对于羟色胺具有强烈的灵敏度——羟色胺是记忆形成重要的调控递质。

8. The Transcriptional and Epigenomic Foundations of Ground State Pluripotency
Hendrik Marks, Tüzer Kalkan, Roberta Menafra, Sergey Denissov, Kenneth Jones, Helmut Hofemeister, Jennifer Nichols, Andrea Kranz, A. Francis Stewart, Austin Smith et al.

9. Sequencing Chromosomal Abnormalities Reveals Neurodevelopmental Loci that Confer Risk across Diagnostic Boundaries
Michael E. Talkowski, Jill A. Rosenfeld, Ian Blumenthal, Vamsee Pillalamarri, Colby Chiang, Adrian Heilbut, Carl Ernst, Carrie Hanscom, Elizabeth Rossin, Amelia M. Lindgren et al.

在一项运用新方法探寻难以找到的染色体异常的新研究中,实验室管理研究人员已确定了33个基因与孤独症等相关疾病有关,其中22个基因是首次被鉴定。这些基因似乎也以不同的方式影响精神分裂症等精神疾病的个体。

10. Evolution of Human-Specific Neural SRGAP2 Genes by Incomplete Segmental Duplication
Megan Y. Dennis, Xander Nuttle, Peter H. Sudmant, Francesca Antonacci, Tina A. Graves, Mikhail Nefedov, Jill A. Rosenfeld, Saba Sajjadian, Maika Malig, Holland Kotkiewicz et al.

来自华盛顿大学医学院,加州大学旧金山分校的实验室管理研究人员利用新型测序技术,发现了将人类与亲缘关系最近的灵长类动物区分开来的一种关键特征:一个基因的重复拷贝,这项成果公布在Cell杂志在线版上,与同期的另外一篇文章,共同揭示了这个人类独有的基因拷贝的奥秘。 这项研究表明第二次最近的复制事件只产生了这个基因的部分拷贝,这个拷贝发生在精确时间,精确位置上,可以与原始基因相互作用,阻断后者的功能。

关键词:Cell杂志 文章盘点 实验室管理 protocol

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