结肠癌中有缺陷的蛋白

    对超过70个原发性人结肠肿瘤和相匹配的正常控制组中的外显子组、转录组和版本数改变所做的一项分析，识别出超过35,000个改变蛋白的体细胞突变，其中大多数都已被确认。除了在Wnt通道、染色质重塑和“受体-酪氨酸-激酶”信号作用中所涉及的基因的改变外，本文作者还发现了涉及R-spondin家族成员的重现性基因融合，它们在结肠肿瘤中出现的总体比例为10%；因此，它们可能提供了一个潜在的治疗目标。有证据表明，这些融合也许在Wnt信号作用的激发及肿瘤发生中起一定作用。（Catalog采购助手）

iPS细胞形成过程中的最初步骤

    体细胞被“Yamanaka因子”重新编程为“诱导多能干”(iPS)细胞的早期“外成机制”尚不清楚。Asa Abeliovich及其同事发现，到细胞重新编程的第四天，两个DNA修饰酶Parp1 和 Tet2被吸收到内生多能位点（如Nanog 和 Esrrb）上，导致被改变的胞嘧啶盐基5mC 和5hmC的局部积累。Parp1 和 Tet2通过单独的、但重叠的机制发挥作用，来调控5hmC/5mC比率，后者与转录活性相关。这些发现说明5hmC在“外成重新编程”过程中还有其他作用。（Everlab-E3实验室管理）

Cyclic-di-GMP 信号在“盘基网柄菌”中的作用

    第二信使是将来自受体的信号中继到细胞内预定目标的小分子。Cyclic-di-GMP是细菌中一种普遍存在的第二信使，比如说在生物膜的形成中就是活跃的，但此前一直没有在真核细胞中被观察到。现在，Zhi-hui Chen 和 Pauline Schaap演示了c-di-GMP在一种真核生物中所起的作用。这种真核生物即“盘基网柄菌”，从演化上来讲是一种古老的社会性阿米巴（变形虫），它已成为细胞和发育生物学上的一个模型体系。本文作者发现，人们长期寻找的、在阿米巴中诱导多细胞分化（柄形成）的信号即c-di-GMP。它的合成酶“双鸟苷酸环化酶”专门在子实体端部表达，柄细胞就是在那里分化的。（实验方法Protocol）

 低剂量抗生素怎样增加体重

    连续使用低剂量抗生素几十年来一直被用来增加牲畜的体重，但这一效应背后的机制尚不清楚。通过在年轻小鼠身上采用类似方法，本文作者发现，低于治疗剂量的抗生素能增加身体的脂肪量，使小肠微生物群落的组成发生变化，改变导致短链脂肪酸生成的微生物代谢通道的活性。这些发现凸显了某些微生物在维持正常代谢活动中的重要性。（实验方法）

封面故事: 人类基因组的突变速度

     新生突变之所以重要，是因为它们是演化中多样性的来源，也是因为它们对疾病有直接影响。来自“deCODE genetics”（总部设在冰岛的一个人类基因组研究机构）的科学家和他们的同事，利用来自78个“冰岛患者-后代三人组合”的全基因组测序数据来在整个基因组层面上研究人类的突变速度。他们发现，单核苷酸多态性突变速度的多样化是由父亲在母亲怀上孩子时的年龄支配的。受孕时父亲年龄每增加一岁，突变数量就增加约两个，同时一旦随机差异的效应被考虑进去，父亲的年龄估计就可以解释新生突变数量中几乎所有剩余的差异。而且，这些结果表明，影响男性生殖年龄的人口结构变化会对突变速度产生相当大的影响，因此也会对精神分裂症和自闭症等疾病的发病风险产生相当大的影响。

关键词：Everlab云端实验室  低剂量抗生素  基因组突变  Catalog采购助手