Nature成果:首次公布西红柿基因组
库巴扎新闻列表 | 2012-05-31

近日在Nature杂志上,来自美国康奈尔大学,英国诺丁汉大学,中科院国家基因研究中心等处的研究人员近期发表文章“The tomato genome sequence provides insights into fleshy fruit evolution”,首次公布了西红柿(Solanum lycopersicum)的基因组,此次测序的西红柿品种为Heinz 1706(实验室管理)。

来自康奈尔大学Boyce Thompson植物研究院,以及美国农业部的James Giovannoni领导了美国西红柿测序团队,这一团队由几个研究机构组成,其中野生型西红柿(Solanum pimpinellifolium)基因组序列,由冷泉港实验室完成。西红柿共有约35000个基因,12条染色体,“关于西红柿的各种特性,包括味道,天然抗虫性,以及营养成分等,我们都已经捕获了实质上的几乎所有基因”,Giovannoni说(实验室管理)。

Nature文章详细描述了这些基因的序列,以及其在染色体上的分布,“西红柿基因组序列分析有助于肉质果实的进化研究”,这些信息也将能用于培育人们喜欢的改良后的口味和更加丰富的营养,如番茄红素,除此之外,在降低成本,对抗病原体,干旱和瘟疫等方面,基因组序列也提供了重要信息。而且随着这种西红柿基因组信息的公开,种子公司,以及植物改良人员进行其它类型研究和研发需要的基因组测序,也将更加容易和便宜,Giovannoni说。这首个西红柿基因组测序花费的成本达到了上百万美元,之后的测序也许就能降低到10万美元以下了。

为了能方便研究人员获得西红柿,及其相关物种的基因序列,Boyce Thompson研究院的Lukas Mueller及其团队创建了一个互动网站:www.solgenomics.net,除此之外,Boyce Thompson研究院的费张军(Zhangjun Fei,音译),以及Joyce Van Eck也公布了他们的分析数据。

这项序列分析揭示了西红柿基因的相对关联,这将有助于揭示西红柿基因和其展现的特性之间的关系。西红柿作为茄科家族的成员之一,其新序列也将为确认西红柿茄科亲属,比如土豆,辣椒,茄子和矮牵牛等,提供参考。目前从经济价值和产量来看,茄科家族是世界最重要的蔬菜作物家族(实验室管理)。

关键词:Nature 西红柿基因组 实验室管理

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